Le Dr Keller apparait dans l'épisode Sunday - celui de la mort du Dr Beckett. Etant de service alors que tout le monde est de repos, elle est remplacée par Carson quand celui-ci ne trouve personne pour aller pêcher avec lui. Elle apparait dans les épisodes suivants, en particulier dans First Strike quand elle avoue à Elizabeth qu'elle ne sait pas si elle pourra résister à la pression, se trouvant trop inexpérimentée pour le poste.
Elle devient à partir de la saison 4 un personnage récurrent et important, en tant que remplçante de Carson.

Jason Momoa incarne depuis l'épisode 3 de la saison 2 ("Runner", chasse à l'homme) le Satédien Ronon Dex, asservi en tant que Runner par les Wraiths - durant sept ans - après la destruction complète de son monde natal. Suite à sa rencontre avec l'équipe du Colonel Sheppard - à la recherche de Ford -, il sera débarassé de son traceur par le Dr Beckett, avant d'intégrer l'équipe phare d'Atlantis suite à l'invitation du Col. Sheppard.
Secret et taciturne, l'homme ne se livre pas, même aux propres membres de son équipe.
Les sourires de Ronon sont rares, et l'expression de ses sentiments se limite la plupart du temps à un haussement de sourcil, lorsqu'on lui demande d'exprimer son avis en temps que soldat et membre d'Atlantis.
Si l'on voit sans peine ce qu'il ressent, c'est que l'un des membres de son équipe ou lui-même courent un grand danger. (Masse Critique, Inferno, Sateda).
Le personnage, aussi bourru soit-il, est attachant, probablement par son passé difficile et les horreurs qu'il a pu subir.
John, Teyla, Rodney et Ronon forment une équipe aussi hétéroclite qu'unie, même si il semble inconcevable que Ronon remplace un jour complètement Aiden Ford, tant à cause de l'humour du jeune lieutenant que dans le coeur des fans.

Le docteur McKay est déjà connu des fans de Stargate SG-1 : en effet, il y est déjà apparu dans trois épisodes. Il y interprétait un docteur sûr de lui et agaçant car incapable d'avouer qu'il a tort. Pour Stargate Atlantis, les scénaristes ont gardé ces aspects du personnage mais en les atténuant, ce qui les transforme en facettes très comiques. Il est tout simplement hilarant dans ses tirades et encore plus lors de ses échanges avec le lieutenant-colonel Sheppard.
Enfant, McKay a toujours voulu être un pianiste, mais son professeur le découragea de continuer dans cette voie, croyant que l’art n’avait aucun intérêt. McKay devint alors scientifique car il croyait qu’il serait ainsi le plus loin possible de toute forme d’art, mais il découvrit rapidement que la science était une forme d’art.

    Rodney est un brillant scientifique spécialisé dans les technologies extraterrestres : il est presque aussi doué que Samantha Carter (dont il est fou amoureux, ce qui n'est pas réciproque !). Au début de la série, il ne possède pas le gène Ancien mais se le fait inoculer avec succès dès le troisième épisode : il peut ainsi agir sur les appareils anciens, ce qui lui simplifie la tâche.

    Bien qu'assez trouillard, McKay n'hésite pas à se lancer dans l'action pour aider ses amis comme dans The Defiant One, et ses idées ont bien souvent aider les Terriens à se sortir de situations critiques.

Le Docteur Weir est une brillante scientifique qui maîtrise 5 langues. Weir était initialement un critique des dépenses du gouvernement sur l'armée. Elle prit la décision que la meilleure façon de se battre contre cela était de rejoindre la fonction de militaire en effectuant des changements depuis l'intérieur, et ainsi elle a travaillé dans les coulisses pour le gouvernement américain comme négociateur international de haut niveau. Quand un nouveau Président a été élu, on a offert au Dr. Weir la commande du Programme Stargate, remplaçant efficacement le Général Hammond (fin de la saison 7 de Stargate SG-1). Par la suite, on lui a donné l'occasion de rejoindre la nouvelle équipe partant pour Atlantis, un défi qu'elle n'a pas hésité à relever.

    Elle a donc pris la tête de l'expédition Atlantis : il n'est pas toujours évident pour elle d'imposer ses décisions au milieu d'un univers essentiellement masculin et militaire. Toutefois, elle sait prendre des décisions justes et très vite un profond respect va s'instaurer entre elle et les différents membres de l'équipe. En cas de crise, elle privilégie le dialogue mais doit souvent se résigner à laisser les militaires agir lorsqu'elle est dans l'impasse.
   
    Grâce à ses grandes compétences de linguiste, elle apporte à l'expédition une connaissance inestimable et peut rapidement traduire des dialectes.
Maintenant, dans la galaxie de Pégase où l’expédition Atlantis tente d’améliorer l’humanité, elle dirige le contingent militaire.

Lors de son départ vers Atlantis, Elizabeth quitta au moins une personne très proche, un homme nommé Simon.

Teyla est la chef des Athosiens, un peuple rencontré par les Terriens d'Atlantis peu après leur arrivée dans la galaxie de Pégasus.Elle est aussi la fille de Tagan. Elle a vite été séduite par ces étrangers et n'a pas hésité à les rejoindre quand son peuple s'est retrouvé sans planète et qu'il a été invité à venir séjourner dans la cité. Elle est donc l'une des membres de l'équipe d'exploration, sous les ordres du major Sheppard.
Teyla est une experte du combat au corps à corps et dans le maniement du couteau. Elle connaît bien les Wraith car son peuple en a souvent été victime : elle apporte ainsi à l'expédition des informations indispensables. De même, elle connaît de nombreuses planètes et sait où trouver ce qu'il manque aux Terriens.
    Dans The Gift, elle apprend qu'elle est en partie Wraith suite à des expériences sur ses ancêtres : de ce fait, elle peut activer un lien télépathique entre elle et ses ennemis et peut voir par leurs yeux. Cela lui permet aussi de sentir leur présence à proximité.
    Parfois, elle entre en conflit avec ses amis car elle n'approuve pas certaines méthodes des militaires, qui peuvent manquer de compassion selon elle. Cependant elle croit en la défaite des Wraith et est prête à tout pour atteindre ce but, afin que les peuples de la galaxie puissent vivre en paix.Teyla retourna donc sur Atlantis avec les habitants de Athos, où ils établirent une nouvelle colonie. Elle fait maintenant partit de l’équipe de Sheppard et offre ses services pour trouver de nouveaux alliés pour les humains de Atlantis, et son expérience avec les cultures de la galaxie de Pégase ont font une guide idéale pour les humains de la Terre.